药用玻璃材质瓶包装跟药用玻璃瓶有着密切的关系，药用玻璃瓶的包装形式一般有两种，一种是用瓦楞纸箱盛装的普通包装，另一种是采用PVC或PE膜的热缩包装，另外还有少量的托盘包装。玻璃瓶我国传统的饮料包装容器，玻璃也是一种很有历史的包装材料。在很多种包装材料涌入市场的情况下，玻璃容器在饮料包装中仍占有着重要位置，这和它具有其它包装材料无法替代的包装特性分不开。从对产品的保护程度及清洁度要求来看，热缩包装及托盘包装的质量要远远优于普通的纸箱包装。现在发展成PE膜热缩后放入纸箱，干净卫生，可以做到无菌（fungus)包装，这也是今后药用玻璃瓶的发展方向。
药用玻璃瓶的包装前一般都有一个对产品全检的过程，称为核验查收工序，这个工序又分为人工检验和自动检验两种。目前国内药用玻璃瓶大都采用人工检验的方法，在强光检验台的照射下，对每个瓶子进行目测，剔除（reject）外观缺陷的不合格品，人工检验由于受目测、经验等各种条件的限制，漏检率相对较高，劳动强度也很大，而自动检验，则可以对瓶子的尺寸、外观、缺陷等进行检验，漏检率比较低，也是提高药用玻璃瓶质量水平的发展方向和有效途径。
国内药用玻璃瓶基本还是沿用人工目测装箱及热缩膜包装形式，主要设备为打包机和红外线热缩机等，国外同类产品基本都采用在线自动检测，自动包装，除了大化减少了大量人力，降低劳动强度外，更重要的是自动检测包装生产（Produce）线可以有效地完成对不合格品的剔除（reject），保证了产品的稳定性和一致性，而且大大地提高了劳动生产率和产品的质量。
